พันธกิจกองประกันคุณภาพการศึกษา ยศ.ทร.
๑. พัฒนาระบบประกันคุณภาพการศึกษา กำหนดรอบแนวทางการปฏิบัติ และวิธีการประเมินคุณภาพภายใน
ให้สอดคล้องกับการประกันคุณภาพการศึกษาของกองทัพไทย และการประกันคุณภาพศึกษาภายนอก
๒. พัฒนามาตรฐานการศึกษา กำหนดตัวบ่งชี้ และเกณฑ์การประเมินให้กับสถานศึกษาในบังคับบัญชาและในกำกับของ ยศ.ทร.
๓. ส่งเสริม สนับสนุน และติดตามให้สถานศึกษาในบังคับบัญชาและในกำกับของ ยศ.ทร.ดำเนินการประกันคุณภาพภายในอย่างต่อเนื่อง
๔. ส่งเสริมและพัฒนากำลังพลภายในหน่วย และสถานศึกษาในบังคับบัญชาและในกำกับของ ยศ.ทร.ให้มีความรู้ความสามารถในการปฏิบัติหน้าที่เป็นผู้ประเมินของ ทร.ได้อย่างมีคุณภาพ
๕. พัฒนาระบบเทคโนโลยีสารสนเทศ ให้สามารถรับการปฏิบัติงาน และใช้เป็นเครื่องมือในการแลกเปลี่ยนเรียนรู้ จนเกิดเครือข่ายความร่วมมือทางวิชาการระหว่างสถานศึกษาและหน่วยงานภายนอก

ค่านิยมกองประกันคุณภาพการศึกษา ยศ.ทร.

๑. มีความรอบรู้ มุ่งปฏิบัติงานแบบมืออาชีพที่ได้มาตรฐานและมีคุณภาพ
๒. สมัครสมาน สามัคคี ร่วมมือร่วมใจพัฒนา การบริหารจัดการองค์กร ให้มีการปฏิบัติงานที่โปร่งใสตรวจสอบได้ คำนึงถึงประสิทธิผล ประสิทธิภาพ และความถูกต้องรวดเร็ว
๓. ส่งเสริมพัฒนาทักษะความสามารถของกำลังพล เพื่อให้มีความสามารถปฏิบัติงานและแก้ไขปัญหาได้
๔. ยกย่องนับถือผู้ที่มีความรู้ ความสามารถ มีความรับผิดชอบ มีความชื่อสัตว์สุจริตประกอบคุณธรรมและจริยธรรมที่ดี และรักษาขนบธรรมเนียมประเพณีทหารเรือ
๕. มีทัศนคติที่ดี มีมนุษย์สัมพันธ์ มีความภาคภูมิใจ รับผิดชอบ รักการปฏิบัติงาน พร้อมให้การช่วยเหลือและสนับสนุนผู้อื่นและหน่วยงานต่าง ๆ
๖. ส่งเสริมให้กำลังพลมีคุณภาพชีวิตที่ดี
๗. ประยุกต์ให้เทคโนโลยีสารสนเทศให้เกิดฐานข้อมูลที่ถูกต้องและละเอียดเพียงพอที่จะช่วยตัดสินใจ พัมนาและเปลี่ยนแปลงกระบวนการบริหารจัดการให้มีประสิทธิภาพยิ่งขึ้น
๘. มุ่งเน้นพัฒนาให้เป็นองค์กรแห่งการเรียนรู้